Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPMQ9NSP4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CENPMQ9NSP4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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