Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.6 ms