Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms