Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TINF2Q9BSI4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms