Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms