Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms