Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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