Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSPG4P5Q96PW8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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