Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPRD1AQ96P16 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms