Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms