Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms