Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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