Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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