Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC10Q969S8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms