Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms