Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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