Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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