Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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