Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms