Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF549Q6P9A3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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