Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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