Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms