Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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