Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHYHD1Q5SRE7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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