Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FREM1Q5H8C1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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