Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms