Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms