Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDRF1Q3B7T1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms