Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms