Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HFEQ30201 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HFEQ30201 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HFEQ30201 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HFEQ30201 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HFEQ30201 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HFEQ30201 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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