Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HADHQ16836 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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