Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms