Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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