Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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GRIK5Q16478 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GRIK5Q16478 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GRIK5Q16478 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GRIK5Q16478 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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