Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms