Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms