Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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