Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms