Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms