Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms