Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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