Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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