Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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