Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.1 ms