Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCOF1Q13428 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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