Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAA1Q13131 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms