Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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