Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms