Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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