Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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